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安生水
利用sed 命令去掉windows下回车符
在Windows中文件的换行符与linux中是不同的，其在linux中显示为^M，在使用脚本处理时并不希望有这个符号，所以需要去掉此符号，其方法如下： sed -i 's/^M//g' test.txt ^M 是回车换行符...
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- 安生水
- 发布于 2018-08-23 18:22
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linux 从文件中随机抽取部分数据
如何从某一个文本文件中随机抽取一部分数据。譬如右下方这样的基因表达量数据的统计文件ref_trans_full_table.xls目标是由此文件中随机抽取一部分数据。 可以利用shuf获取随机数据，譬如随机...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-31 17:04
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Daitoue
linux下解压命令
在下载或上传文件时，会碰到很多压缩文件，种类较多，这里就介绍一下各种常见类型的文件如何压缩以及解压缩
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- 安生水
- 发布于 2018-06-14 17:44
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fastq文件查看指定序列
在处理fastq文件时，可能会遇到序列与质量值长度不一致或格式不正确等问题，这时候软件会报告哪条序列有问题，并给出序列ID，然后我们就要去查看这条序列是什么问题。但是，fastq文件通常是很大的，使用less命令可能很难搜索到
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- 安生水
- 发布于 2018-06-08 11:48
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linux系统中ls命令的常用用
ls命令是linux下最常用的命令。ls命令就是list的缩写,缺省下ls用来打印出当前目录的清单，如果ls指定其他目录，那么就会显示指定目录里的文件及文件夹清单。通过ls 命令不仅可以查看linux文件夹...
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- landy
- 发布于 2018-06-01 13:18
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landy
smyang2018
linux命令如何对两个文件去重复
例如你有两个基因id文件，你想知道这两个文件共有的id，怎末办呢？一行命令就可以解决。cat 文件1 文件1 |sort|uniq 输出的就是这两个文件的并集cat 文件1 文件1 |sort|uniq ...
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- landy
- 发布于 2018-05-11 13:54
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Linux生物信息分析环境搭建
想做生物信息分析，但不知道怎么入门？先来搭个环境吧！想分析数据，但是分析不了？先来搭个环境啊！搭建好环境，后面的自然就简单多了。 我们平时大都会使用Windows，而很少使用Linux，然而做...
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- 安生水
- 发布于 2018-04-22 23:08
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一条命令能解决多少数据处理问题？
继Linux生信入门，我们又出新课程啦！本期课程我们讲的是Linux命令的使用及怎么用来处理生物数据。
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- 安生水
- 发布于 2018-04-22 11:11
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