OTU互作网络分析用MENA
MENA，一个可以利用OTU数据进行在线分子生态网络分析的网站，帮你搞定OTU互作网络图。
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- Daitoue
- 发布于 2018-04-22 21:19
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Daitoue
微生物与环境因子，代谢物，功能等相关性分析linkET
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- omicsgene
- 发布于 2023-12-19 08:20
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omicsgene
方差分解分析（Variance Partitioning Analysis）
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- omicsgene
- 发布于 2020-11-22 20:19
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qiime2 分类器建立 SILVA数据库
https://forum.qiime2.org/t/processing-filtering-and-evaluating-the-silva-database-and-other-reference-sequence-data-with-rescript/15494
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- omicsgene
- 发布于 2020-11-21 08:24
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qiime2 vsearch OTU 以及 ASV流程整理
qiime2 vsearch OTU pip 整理
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- 发布于 2020-11-06 13:17
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Morii
biom格式的文件如何转化
biom格式的文件如果想要删除某个物种啥的,转换以后直接修改是不行的 先转化成tsv biom convert -i bak/feature_table_tax.biom -o feature_table_tax.tsv --to-tsv --header-key taxonomys l...
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- xun
- 发布于 2024-07-23 15:29
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xun
An introduction to PERMANOVA and ANOSIM
PERMANOVA（Permutational Multivariate Analysis of Variance）和 ANOSIM（Analysis of Similarities）都是用于分析和比较群组间多元数据差异的统计方法。它们特别适用于生态和环境科学领域，...
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- xun
- 发布于 2024-06-05 14:33
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微生物多样性扩增子（16S/18S/ITS）课程更新v2.0
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- 发布于 2023-12-05 13:25
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kraken2生成的biom文件处理
使用kraken2软件做宏基因组或扩增子项目物种注释项目的时候，如果后续不使用bracken则可能会遇到一个问题，结果生成的biom文件中taxonomy并不是最终结果，比如下面这样 可以用脚本来处理，删...
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- xun
- 发布于 2023-05-31 17:33
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