基于perl 提取基因家族内的串联重复基因对
perl 中 grep 的使用
perl 中 $#ARGV 是什么意思
Array::Utils ,perl中对两个数据取交集,并集 差集等等,union,intersect,diff等操作
介绍两个perl中的包,分别可以读取Excel的文件,包括2003 的xls文件,和2007的xlsx的文件。Spreadsheet::ParseExcel; Spreadsheet::ParseXLSX;
miRNA与靶基因相关性作图
在没有位置信息时,提取miRNA前后500bp的序列
有时候我们需要得到序列的反向互补序列,可以用下面的脚本来批量处理序列。
从nwk文件中提取基因ID
2维韦恩图各部分基因上下调数量统计
简便好用的序列提取的perl脚本
perl中的正则表达式
将Windows中该文件的内容粘贴复制到linux文件中,用perl读取并保存到哈希中,然后读取另一文件的第一行,判断他第一列的内容是否在上一个文件中存在,结果总是不存在,然而明明就在啊,怎么会不存在呢,一遍遍检查代码也找不到问题。到底为什么呢?
perl中如何随机抽取数组中的一个元素。
ActivePerl安装perl模块
正则表达式(regular expression)描述了一种字符串匹配的模式,可以用来检查一个串是否含有某种子串、将匹配的子串做替换或者从某个串中取出符合某个条件的子串等。 Perl语言的正则表达式功能非...
有时候们会需要基因的启动子序列,这里有脚本可以提取基因组所有基因的启动子序列。
SNP2CAPS可将SNP转换为CAPS标记,其具体用法: perl SNP2CAPS.pl chr5D:9950377.fa_1 link_gcg AanI,AarI,AasI,AatII,Aba6411II,AbaB8342IV,AbaCIII > chr5D:9950377.txt 其中...
在merged.gtf文件中有所有外显子的信息,下面的脚本可根据此文件提取转录本的所有外显子位置信息。 merged.gtf文件实例: Chr00 Cufflinks exon 37990 38333 . + ...
perl中通过文件操作符glob提供相当于shell中的指定多个文件的“通配符”语法功能,文件操作符glob将返回与所指定的glob文件模式相匹配的所有文件的list。