简便好用的序列提取的perl脚本
用perl批量处理文件夹下所有文件 opendir()获取目录权柄;readdir()读取目录下文件 #!/usr/bin/perl -w $dirname = "/tmp"; #指定一个目录 opendir ( DIR, $dirname ) || die...
Perl 入门 之 context 标量上下文与列表上下文
Perl 子程序(函数)
提取基因的转录本信息,以及对应的基因ID;
有时候们会需要基因的启动子序列,这里有脚本可以提取基因组所有基因的启动子序列。
截取,反向互补,读入,写出,筛选等
Perl去除一个数组中的重复元素
perl中判断数组中是否含有某个元素
get_gene_exon_from_gff.pl 脚本更新,
提取合并基因家族的domain序列
Perl 包和模块
perl中变量命名规则
perl中q,qq,qw的区别
从nwk文件中提取基因ID
perl中如何随机抽取数组中的一个元素。
ActivePerl安装perl模块
perl中通过文件操作符glob提供相当于shell中的指定多个文件的“通配符”语法功能,文件操作符glob将返回与所指定的glob文件模式相匹配的所有文件的list。
Perl提取指定位置的基因序列用到 substr 函数,用法: $gene = substr( $fasta,$start-1, $end - $start+1); 其中$fasta是总的序列;$start是提取序列的开始位置,由于Perl字符串是从0计数的...
怎么用Perl脚本得到反向互补序列