SNP 过滤标准保证数据质量及参考文献:

最近有审稿人问我们的SNP过滤标准的合理解释,这里总结一下相关的参考文献和标准的出处

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-04-12 16:59
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bcftools建索引报错:Chromosome blocks not continuous

bcftools建索引时报错“染色体区段不连续”

老师您好,请问在群体遗传进化中,模板数据黄瓜的分组,sample 是指的什么?是测序数据下机的样品编号?

不太理解就是当所有的下机数据合并成vcf文件,后续需要建树和扫描清除分析时应该怎么填写分组txt?

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  • shidandan
  • 发布于 2023-11-02 09:41
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基因组重测序docker镜像更新到2.0

基因组重测序docker镜像更新到2.0

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  • 发布于 2023-10-16 10:12
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CNVnator 安装报错

CNVnator 安装报错

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  • 发布于 2023-10-11 14:42
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ANNOVAR 基于gff中基因的位置简单注释

ANNOVAR 基于gff中基因的位置简单注释

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  • 发布于 2023-06-13 09:46
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stacks RAD 分析方法

stacks RAD 分析方法

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  • 发布于 2023-04-19 13:40
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多款软件进行vcf合并--gatk、vcftools、bcftools

链接:https://www.jianshu.com/p/116c8e4c93f4

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  • 星莓
  • 发布于 2022-09-21 18:00
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GATK外显子测序数据肿瘤体细胞突变数据分析

GATK外显子测序数据肿瘤体细胞突变数据分析

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  • 发布于 2022-02-11 16:14
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vcf文件annovar的注释结果绘制瀑布图maftools分析

vcf文件annovar的注释结果绘制瀑布图maftools分析

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  • 发布于 2022-01-04 13:04
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bcftools call SNP

bcftools call SNP

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  • 发布于 2021-09-22 18:16
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BSA分析中MutMap 分析:95% 99%阈值置信区间是如何计算的

BSA分析中MutMap 分析:95% 99%阈值置信区间是如何计算的

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  • 发布于 2020-07-21 13:02
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BSA分析中QTL-seq 分析:95% 99%阈值置信区间是如何计算的

BSA分析中QTL-seq 分析:95% 99%阈值置信区间是如何计算的

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  • 发布于 2020-07-21 12:51
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GATK Hard-filter 过滤变异结果推荐阈值

GATK Hard-filter 过滤变异结果推荐阈值

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  • 发布于 2020-06-25 09:38
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BSA分析之MutMap分析原理详解!

BSA分析之MutMap分析原理详解!

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  • 发布于 2020-06-08 13:32
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SNP指纹图谱软件SNPT

SNP指纹图谱软件SNPT

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  • omicsgene
  • 发布于 2019-12-12 16:26
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BSA分析算法中的ED算法和SNP-index有什么区别?

ED和snp-index是进行BSA基因定位时最常用的算法,本文简述了两者的区别。

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  • omics007
  • 发布于 2019-08-02 12:30
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外显子测序发现遗传性NK/T细胞淋巴瘤癌与FAM160A1基因突变相关

外显子测序发现遗传性NK/T细胞淋巴瘤与FAM160A1基因突变相关

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  • 发布于 2019-05-24 16:55
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外显子测序解析卵巢早衰的遗传因素

外显子 测序

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  • 发布于 2019-05-24 16:51
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变异结果 vcf 格式转换成 hapmap格式

格式转换

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  • omicsgene
  • 发布于 2019-05-09 15:38
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