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CentOS 7 yum安装报错

CentOS 7 yum安装报错

BaiduPCS-Go 报错 | 上传文件失败, 分片上传—合并分片文件: 遇到错误, 远端服务器返回错误, 代码: 31352, 消息: commit superfile2 failed

在使用BaiduPCS-Go上传文件时报错： [1] ↑ 1.03GB/1.03GB 1.81MB/s in 39s ............[1] 上传文件失败, 分片上传—合并分片文件: 遇到错误, 远端服务器返回错误, 代码: 31352, 消息: commit...

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  • rzx
  • 发布于 5天前
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samtools | 提取部分染色体的bam信息

01. samtools提取bam文件中某部分染色体相关信息 samtools view -b -h XX.bam chr1 chr4 >XX2.bam 02. samtools构建bam文件的索引 samtools index XX2.bam

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  • rzx
  • 发布于 5天前
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Trinity报错“Error, not recognizing read name formatting”

在使用trinity做de novo的时候，发现软件报错了

openssl 安装

https://openssl-library.org/source/old/3.0/index.html

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-12-18 14:29
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hisat2-build报错：Error: Encountered internal HISAT2 exception (#1)

hisat2-build报错：Error: Encountered internal HISAT2 exception (#1)

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  • 安生水
  • 发布于 2024-12-11 15:15
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文件夹名称中存在空格，scp如何正确识别

如果文件夹名称中有空格，如果不进行特殊处理scp指令无法对文件夹名称进行正确识别，就会出现“No such file or directory”的报错信息

IF=4.3 | 秋茄树SOS1基因家族分析

“ 2024年8月《BMC Plant Biology》发表了一篇题为“SOS1 gene family in mangrove (Kandelia obovata): Genome-wide identification, characterization, and expression analyses under salt and...

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  • rzx
  • 发布于 2024-12-04 10:11
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linux 编码转换

在linux里面编辑二进制文件有以下两种方法： 1. vim 打开二进制文件： vim -b 文件 将内容转换成16进制： :%!xxd 转换回来： :%!xxd -r  2. iconv  # 将UTF-8编码的wx.txt文件转换为GB...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-12-03 14:56
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ImportError: pycurl: libcurl link-time ssl backend (nss) is different from compile-time ssl backend (none/other)

ImportError: pycurl: libcurl link-time ssl backend (nss) is different from compile-time ssl backend (none/other)

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-11-29 15:30
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docker 镜像重命名/更改版本号

介绍如何修改已经load的镜像的镜像名/版本号

绘制Upset 图

Upset 图（Upset Plot）是一种用于可视化集合间交集的图表，是传统维恩图的替代方法，特别适用于集合个数多或交集关系复杂的场景。它通过柱状图、点图和辅助条形图来直观展示集合交集的大小及分布。

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-28 11:01
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组装"预实验" | 物种倍性分析

倍性直接影响基因组的大小和复杂性，不同倍性的物种需要不同的组装策略，了解物种的倍性对于基因组组装至关重要

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-11-25 15:22
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annovar的染色体识别问题

如果是非数字形式的染色体编号（尤其是其中有特殊字符），annovar的注释可能会有问题，需要改成数字格式

甲基化水平计算

甲基化水平计算

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-21 14:20
  • 阅读 ( 288 )

scanpy 中 ScTransform分析：

scanpy 中 ScTransform分析：

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-11-20 08:23
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seqkit | 对fa序列文件中序列长度进行筛选

seqkit seq -m 50 XX.fa > XX1.fa 将XX.fa文件中序列长度低于50的序列删除

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  • rzx
  • 发布于 2024-11-19 19:01
  • 阅读 ( 246 )

R 安装github包报错：

R 安装github包报错：

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-11-18 15:42
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R公式中如何加入变量

expression（）函数是没办法同时代入公式和变量，这个时候我们可以使用另一个函数来替代——bquote（）

空间转录组数据读取

10x公司的空间转录组的数据一般有两种获取方式,第一是手里直接拿到有matrix和img文件(当然还需要对应的barcord和json等辅助文件),第二是公司直接提供或者从网络上下载到的原始数据,fq文件,那我...

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  • xun
  • 发布于 2024-11-13 16:56
  • 阅读 ( 279 )