准备好分析需要的文件,在GSEA官网下载分析软件(软件可以免费下载,需要配置java环境)就可以进行GSEA分析。 打开分析软件,第一步是载入数据,如下图所示,点击红箭头指向的1出的Load data会...
转录因子在TCGA中的调控分析
转录因子的结合序列查找
文章投稿,除了文好当然还要“颜好”!在这个看脸的世界,为了给文章加分,各位老师学生也是做足功课了!但是不会编程敲代码?——那必须学学各种绘图小工具了。 热图是属于生命科学类型文章中非常...
列举了19个OrgDB,物种对应的全基因组注释R包,方便根据EntreZ进行基因的注释分析等等 物种 OrgDB 按蚊(Anopheles) org.Ag.eg.db 拟南芥(Arabidopsis) org.At.tair.db 牛(Brov...
快速绘制DNA Logo
biolinux共享目录创建及注意事项。
行数不同的数据读入R,批量去除NA,绘制韦恩图。
生物信息学 基因 ID 转换
Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色。
R统计不同差异组合,上下调基因个数;并用ggplot2绘制柱状图。
统计相同ID出现的频率,并用ggplot绘制柱状图;
R语言,按数值范围统计频次,绘制柱状图
按范围统计数值分布,并用ggplot2绘制饼图;
2018年,《Science》一篇研究论文通过对上百万例实验样品数据进行分析,揭示不同精神疾病之间享有共同的遗传变异,然而神经性疾病表现更为独立。
Excel表包含信息有:期刊全名、简写名、(2018及2017年)中科院分区、影响因子、学科分类、SCI/SCIE、投稿难易程度、审稿周期及期刊主页链接;并通过红、绿两种颜色来区分升级和降级期刊,期刊分区变化一目了然!进来下载!
2018年最新生命科学类SCI影响因子及中科院分区统计
在使用MEGAN软件绘制分类学树状图时,如果物种较少,生成的图片会有大片的黑色区域,很不美观。
正则表达式(regular expression)描述了一种字符串匹配的模式,可以用来检查一个串是否含有某种子串、将匹配的子串做替换或者从某个串中取出符合某个条件的子串等。 Perl语言的正则表达式功能非...
介绍plantregmap网站的一些分析转录因子的功能