在merged.gtf文件中有所有外显子的信息,下面的脚本可根据此文件提取转录本的所有外显子位置信息。 merged.gtf文件实例: Chr00 Cufflinks exon 37990 38333 . + ...
将GEO数据库中的注释文件整理成GSEA软件可以使用的芯片注释文件
perl中通过文件操作符glob提供相当于shell中的指定多个文件的“通配符”语法功能,文件操作符glob将返回与所指定的glob文件模式相匹配的所有文件的list。
最近又有人遇到mega构建进化树时报错,所以分享一下这个经验给大家。 Oops!MEGA has encountered an error and cannot continue with this analysis:Some pairwise distances could not be estimated.For example,between sequences 23 and 11.
聚合酶链式反应,其英文Polymease Chain Reaction(PCR)是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法,由高温变性、低温退火及适温延伸等几步反应组成一个周期,循环进行,使目的DNA得以迅速扩增,...
endnote引用书籍的章节。
系统聚类Hierarchical clustering(层次聚类、谱系聚类)— 最短距离法(single linkage)— 最长距离法 (complete linkage)— 中间距离法 (median method)— 可变距离法 (flexible median)— 重心...
最近有关计算KaKs的输入文件,有人提出了问题,说是不是可以通过修改后缀名称aln变为axt来改变文件,变成软件可识别的格式?答案是不可以的,因为aln文件跟axt文件的格式是不一样的,因此只能通...
随着分子生物学研究方法的发展,很多的研究领域都越来越多的分析到了蛋白层面,下面我们就简单介绍几种常用的蛋白互作研究方法: 酵母双杂交: 酵母双杂交由Fields在1989年提出,它的产生...
列举ggplot2的geom设置内容,方便查找绘图对应方法
linux命令处理fasta序列
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自己没有数据,或者科研经费较少或者紧张,科研实验还要继续,利用GEO数据库筛选分子再做后续分析不失为一种经济而又快速的方法。本文详细讲解如何利用GEO数据库在线工具分析差异基因筛选全过程。
GEO2R是GEO在线分析工具,基于此工具可以对部分GEO样品数据进行基因差异表达分析。
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做方差分析,用Excel,简单、快捷、方便,你值得拥有!
>>方差分析之双因素方差分析 小编在节前做过一期使用excel表进行单因素方差分析的推送,反响不错,小编也颇受鼓舞!但是,在许多情况下,单因素方差分析已经不能满足实际分析的需要。比...
荧光定量虽小,细节问题挺多!正所谓“千里之行始于足下,万里之堤溃于蚁穴!”让我们从一做起!
成为一个资深的生物学科研汪必备的实验技能,你有必要来看看你知道多少!
PubMed文献搜索的一个实用技能--如何按照影响因子进行筛选文章?