merged.gtf 合并同一转录本的exon位置

在merged.gtf文件中有所有外显子的信息,下面的脚本可根据此文件提取转录本的所有外显子位置信息。 merged.gtf文件实例: Chr00   Cufflinks       exon    37990   38333   .       +      ...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-22 15:09
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如何将GEO芯片注释文件整理成GSEA能使用的芯片注释文件?

将GEO数据库中的注释文件整理成GSEA软件可以使用的芯片注释文件

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  • landy
  • 发布于 2018-06-22 15:01
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perl 中glob函数

perl中通过文件操作符glob提供相当于shell中的指定多个文件的“通配符”语法功能,文件操作符glob将返回与所指定的glob文件模式相匹配的所有文件的list。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-22 14:29
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MEGA构建进化树遇到报错信息

最近又有人遇到mega构建进化树时报错,所以分享一下这个经验给大家。 Oops!MEGA has encountered an error and cannot continue with this analysis:Some pairwise distances could not be estimated.For example,between sequences 23 and 11.

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-22 14:21
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聚合酶链式反应(PCR)

聚合酶链式反应,其英文Polymease Chain Reaction(PCR)是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法,由高温变性、低温退火及适温延伸等几步反应组成一个周期,循环进行,使目的DNA得以迅速扩增,...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-22 14:00
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endnote 如何插入书籍引用

endnote引用书籍的章节。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-22 13:43
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Hierarchical clustering主要聚类方法与R语言中聚类函数的应用

系统聚类Hierarchical clustering(层次聚类、谱系聚类)— 最短距离法(single linkage)— 最长距离法 (complete linkage)— 中间距离法 (median method)— 可变距离法 (flexible median)— 重心...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-22 12:11
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计算串联重复基因KaKs的时候,aln文件一定要通过脚本转换为axt文件么?这两种文件格式是否可以直接通过修改扩展名来实现?

最近有关计算KaKs的输入文件,有人提出了问题,说是不是可以通过修改后缀名称aln变为axt来改变文件,变成软件可识别的格式?答案是不可以的,因为aln文件跟axt文件的格式是不一样的,因此只能通...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-22 12:07
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浅谈几种常用的蛋白互作实验研究方法!

随着分子生物学研究方法的发展,很多的研究领域都越来越多的分析到了蛋白层面,下面我们就简单介绍几种常用的蛋白互作研究方法: 酵母双杂交: 酵母双杂交由Fields在1989年提出,它的产生...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-22 10:18
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ggplot2几何设置——geom

列举ggplot2的geom设置内容,方便查找绘图对应方法

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-22 09:59
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linux处理fasta和fastq序列

linux命令处理fasta序列

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-21 22:46
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文章问题撰写及发布审核要求

文章发布要求,及审核规定,否则文章、问题、回答、评论将不予审核通过。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-21 17:51
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GEO数据芯片数据挖掘-在线工具分析GDS数据

自己没有数据,或者科研经费较少或者紧张,科研实验还要继续,利用GEO数据库筛选分子再做后续分析不失为一种经济而又快速的方法。本文详细讲解如何利用GEO数据库在线工具分析差异基因筛选全过程。

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-21 17:31
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GEO在线分析工具--GEO2R进行基因差异表达分析

GEO2R是GEO在线分析工具,基于此工具可以对部分GEO样品数据进行基因差异表达分析。

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-21 17:19
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