SCI投稿过程邮件模板
转录因子研究方法
TCGAbiolinks 错误 Error in value[[3L]](cond) : GDC server down, try to use this package later 排查
readxl包括多个可以读取excel的函数,比之xlsx包更方便
下载TCGA基因表达量文件,应该选Count,FPKM还是FPKM-UQ ?
有老师在做基因家族分析时,构建进化树时会报错,如何处理?
rbsurv对生存分析的单因素进行鲁棒性检验
对组装结果中GAP左右批量设计引物
使用GATK call SNP有必要IndelRealigner吗?
利用ggplot2进行火山图的绘制
参考基因组里除了ACTGN以外,还会看到其他一些字符,看一下这些字符都代表什么?
借助reshape2包melt函数对数据进行整形处理,改变数据组合方式
在下载或上传文件时,会碰到很多压缩文件,种类较多,这里就介绍一下各种常见类型的文件如何压缩以及解压缩
以前处理文件路径的时候都是自己写正则表达式,而用perl的模块来解决则更加迅速、准确。
在作芯片数据或者是转录组数据的GSEA分析时候,需要四个文件: 1、基因表达数据文件; 2、表型数据文件; 3、功能基因集文件; 4、芯片注释文件; 这四个文件只需要分析者提供前两个文件即...
在使用GSSE绘制基因结构或者是顺势作用元件时,如果图例太多,在网页展示不出来,这个时候你需要对图片进行修改.增大背景画布就可以显示了,点击下图红色箭头所指按钮,进入到图片编辑界面: 拉...
生存分析的一些基本概念
三元相图查看说明
生存曲线图的绘制
今天跟大家分享一个分析蛋白保守结构域的的网站: 网址:http://www.ebi.ac.uk/interpro/ 在上图的方框导入蛋白序列,点击submit,就开始运行,结果如下图所示: 这个网站不仅分析了蛋白的保...