轻松搞定fasta索引文件、序列提取
fasta是常用的序列存储格式，很多软件（如GATK、IGV等）在导入序列以及进行快速查找时通常需要建立索引文件。本文介绍如何使用 samtools 便捷的建立fasta文件的索引以及快速进行序列提取。
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- 安生水
- 发布于 2018-04-22 11:05
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安生水
这种机器学习算法已经在微生物分析中成功应用
《Nature》发文证明了某种机器学习算法能够对微生物群落样本进行有效且准确的分类，并且可以找出能够区分组间差异的关键成分（OTU或物种）。本文介绍了该算法的实现形式和应用。
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- 安生水
- 发布于 2018-04-22 10:58
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怎么做一张好看的分类学树状图
在做微生物多样性分析时，经常会接触到分类学树状图。今天分享一款很不错的分类学组成信息可视化软件——GraPhlAn，用它生成的图会更好看哦！
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- 安生水
- 发布于 2018-04-22 10:55
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跨物种进化研究必备的‘单拷贝直系同源基因’如何查找
例用Orthomcl查找同源基因，并最终找到单拷贝的直系同源基因。
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- 安生水
- 发布于 2018-04-22 10:51
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NCBI批量下载数据,省时又省力
对于从NCBI大批量的进行数据下载，手动操作无疑是一项沉重的工作，因此可以批量下载数据的方法十分必要。本文介绍如何实现这一方法及后续的一些数据处理方法。
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- 安生水
- 发布于 2018-04-22 10:47
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正选择分析之 Site Models
作为常用的正选择分析方法，计算Ka/Ks方法较为严格。本文介绍利用Sites Model方法来分析正选择基因。
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- 安生水
- 发布于 2018-04-22 10:39
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生信老顽童
鉴定组装植物病毒——系统详尽的植物病毒学！
一本系统详尽讲述植物病毒的书-Plant Virology Protocols（文末有获取方式），堪称病毒学研究里程碑式巨制。主要内容是如何鉴定组装植物病毒！
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- 红橙子
- 发布于 2018-04-21 22:56
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红橙子
做基因定位？大家可能忽略了这个最熟悉的技术
用测序做基因定位，重测序和简化测序一定会首先映入大家的脑海。有一个我们最熟悉的测序产品反而不那么显眼了，其实转录组也是可以用来做基因定位的，而且效果还不错哦！
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- microRNA
- 发布于 2018-04-21 22:52
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microRNA
当下，转录组文章怎么写？
以一篇今年发表在《BMC Genomics》上的转录组文章为切入点，探讨18年转录组文章需要怎么写？
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- 红橙子
- 发布于 2018-04-21 22:44
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已测基因组植物统计（增补完善版），建议收藏！
阅读20000+的已测基因组物种列表更新了，截止于2018年3月最新最全版，建议收藏！
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- 红橙子
- 发布于 2018-04-21 22:30
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研究miRNA必备的分析网站汇总！
向大家介绍一下miRNA靶基因预测，功能研究，定量引物设计等相关的一些网站，值得您收藏。
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- microRNA
- 发布于 2018-04-21 22:07
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国宝吃竹子并非发自内心-比较基因组学分析揭示大熊猫“心路历程”
熊猫吃竹子，貌似天经地义，但是最新的比较基因组学研究证明，国宝吃竹子并非心甘情愿！
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- omics007
- 发布于 2018-04-21 21:03
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omics007
重测序遗传图无验证刊发在《GIGA SCIENCE》上
随着Illumina发布了novaseq，测序成本的进一步降低，以及越多越多的物种公布了基因组，可以确定的是重测序将在越来越多的物种里取代简化测序成为构建遗传图谱的首选方法。
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- omics007
- 发布于 2018-04-21 20:41
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