解决umount: /home: device is busy
umount -l /home 强行解除挂载
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- omicsgene
- 发布于 2023-06-07 14:08
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omicsgene
运行命令makeblastdb建库时报错，生成pdb-lock 空文件。
运行命令makeblastdb -in all.pep.fa -dbtype prot -title all.pep.fa 时卡住报错，生成all.pep.fa.pdb-lock 空文件。 解决：makeblastdb 工具版本问题，从2.13.0版本改成2.6.0版本，就可以...
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- rzx
- 发布于 2023-06-05 15:20
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rzx
安生水
kraken2生成的biom文件处理
使用kraken2软件做宏基因组或扩增子项目物种注释项目的时候，如果后续不使用bracken则可能会遇到一个问题，结果生成的biom文件中taxonomy并不是最终结果，比如下面这样 可以用脚本来处理，删...
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- xun
- 发布于 2023-05-31 17:33
- 阅读 ( 1406 )
xun
多分组venn图绘制脚本
绘制多分组venn图时发现好多包都不支持，只能用原始的包，脚本如下 #!/share/work/biosoft/R/latest/bin/Rscriptargs <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)library(venn)library(VennDiagra...
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- xun
- 发布于 2023-05-30 18:05
- 阅读 ( 1240 )
blastn使用教程及结果详解
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) 是我们常用的短序列比对工具，直接输入fasta格式的序列文件就可进行比对
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- 星莓
- 发布于 2023-05-29 14:49
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星莓
dell R430启动失败 NVRAM_CLR jumper
dell R430启动失败 NVRAM_CLR jumper
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- omicsgene
- 发布于 2023-05-27 12:33
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空间代谢组学|质谱成像技术原理解读
空间代谢组学（Spatial Metabolomics）是整合质谱成像（Mass Spectrometry Imaging，MSI）和代谢组学（Metabolomics）技术，对动/植物组织中代谢物的种类、含量和空间分布进行精准测定的技术，...
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- rzx
- 发布于 2023-05-19 15:48
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python2运行lefse软件的时候报错
使用python2运行lefse软件的时候报错这是因为当前LEfSe依赖的R包rpy2的版本与你的R版本不兼容，你可以尝试更新一个rpy2的小版本，比如我更新了 pip2 install rpy2==2.8.6 随后就可以直接使用...
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- xun
- 发布于 2023-05-12 18:06
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综合转录组学和代谢组学分析揭示了菜豆响应冷胁迫的关键调控网络
文章链接：https://bmcplantbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12870-023-04094-1 一、实验样本准备 实验物种：冷敏感菜豆品种093和抗冷菜豆品种120材料处理：将所有菜豆种子在25° 日...
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- rzx
- 发布于 2023-05-12 16:05
- 阅读 ( 1136 )
Minimap2安装与使用
minimap2是生信大牛Heng Li在2018年发表的三代序列比对工具。与传统的bwa相比，Minimap2可以用于三代测序， 也支持 splicing awared 比对；与一些传统三代比对工具相比，Minimap2 速度非常快，...
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- 星莓
- 发布于 2023-05-12 11:07
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回归分析中R2的意义
回归分析中R2指的是结果变量（y）的观测值与y的拟合（即预测）值之间的相关系数；因此，R的值将始终为正，范围为0至1。 相关系数R2：表示你的曲线线性是否很好，理想状态是1，但是达不到。一般...
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- rzx
- 发布于 2023-05-10 11:51
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典型相关性分析CCA与冗余分析RDA
1.典型相关（CCA）的基本原理canonical correspondence analysis 典型相关分析是研究两组变量之间关系的一种多变量统计分析方法，它可以反映两组变量之间的相互依赖的线性关系。设两组变量用x1...
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- rzx
- 发布于 2023-05-09 17:37
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