R语言当中的包主要来自两个地方:
1. 官方网站的资源库CRAN
2 . bioconductor上的包
不同来源的R包安装方法不同,见下面:
#设置镜像,这部分代码复制粘贴运行就可以 local({r <- getOption("repos")
r["CRAN"] <- "https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"
options(repos=r)}) #然后在安装需要的包
install.packages("ggplot2")
install.packages("ggplot2",repos="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")
TUNA Team, Tsinghua University | |
TUNA Team, Tsinghua University | |
University of Science and Technology of China | |
University of Science and Technology of China | |
Lanzhou University Open Source Society | |
Lanzhou University Open Source Society | |
Xiamen University |
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("DESeq2")
#设置镜像,这部分代码复制粘贴运行就可以
options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
#安装包
BiocManager::install("DESeq2")
R CMD INSTALL mypackage.tar.gz
或者在R终端:
>install.packages("/path/to/mypackage.tar.gz", repos = NULL, type = "source")
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