1.查询镜像：
$ docker search omicsclass
INDEX NAME DESCRIPTION STARS OFFICIAL AUTOMATED
docker.io docker.io/omicsclass/biocontainer-base Biocontainers base Image 0
docker.io docker.io/omicsclass/samtools samtools 1.10 from omicsclass 0
2.下载镜像
docker pull docker.io/omicsclass/samtools:latest
运行镜像并使用samtools对t.fa文件建立索引
$ ll
-rw-rw-r-- 1 biosoft biosoft 70 Mar 16 17:30 t.fa
$ pwd
/biosoft/docker/samtools
$ docker run -v /biosoft/docker/samtools:/work --rm d505ac3f6c30 samtools faidx t.fa
$ ll
total 24
-rw-rw-r-- 1 biosoft biosoft 70 Mar 16 17:30 t.fa
-rw-r--r-- 1 root root 14 Mar 16 17:55 t.fa.fai
或者直接可以把当前工作路径传递进去：
docker run -v `pwd`:`pwd` -w `pwd` --rm d505ac3f6c30 samtools faidx t.fa # -w 设置容器中的工作路径
3.总结
是不是很好用，不用安装软件，直接使用samtools，彻底解决安装软件时间；
跟多docker内容见：https://www.omicsclass.com/article/1181
docker基础视频课程：实验室linux生信分析平台搭建
