canda 安装的jcvi 遇到字体错误: UserWarning: findfont: Font family [u'sans-serif'] not found. Falling back to DejaVu Sans (prop.get_family(), self.defaultFamily[fontext]))

canda 安装的jvvi 遇到字体错误:


/biosoft/miniconda/envs/genefamilyenv/lib/python2.7/site-packages/matplotlib/font_manager.py:1333: UserWarning: findfont: Font
family [u'sans-serif'] not found. Falling back to DejaVu Sans
(prop.get_family(), self.defaultFamily[fontext]))


由于服务器里没有这种字体

/.../software/Python-2.7.8/lib/python2.7/site-packages/matplotlib/font_manager.py:1316: UserWarning: findfont: Font family [u'sans-serif'] not found. Falling back to DejaVu Sans
  (prop.get_family(), self.defaultFamily[fontext]))

1. ~/.cache/matplotlib/fontList.json文件存储了matplotlib运行是会调用的字体信息;出现上述错误说明该文件中必然没有Helvetica相关的信息,或者对应的Helvetica.ttf文件;

2. 在网上下载一个Helvetica.ttf文件,放在matplotlib的font目录(***/matplotlib/mpl-data/fonts/ttf/)或者系统的font目录下都行(/usr/share/fonts/);

3. 删除~/.cache/matplotlib目录,重新运行你的画图脚本;此时程序会自动在~/.cache目录下生成matplotlib目录以及fontList.json文件;

一般来说到这里就应该成功了。



更多生物信息课程:

1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程基因家族文献思路解读

2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读转录组(无参)结果解读

3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,提升你的文章档次,学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析

4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘转录组文献解读

5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读OTU网络图绘制cytoscape与网络图绘制课程

6. 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用docker搭建生物信息分析环境实验室linux生信分析平台搭建linux命令处理生物大数据perl入门到精通perl语言高级R语言画图R语言快速入门与提高python语言入门到精通

7. 医学相关数据挖掘课程,不用做实验也能发文章:TCGA-差异基因分析GEO芯片数据挖掘 GEO芯片数据不同平台标准化 、GSEA富集分析课程TCGA临床数据生存分析TCGA-转录因子分析TCGA-ceRNA调控网络分析

8.其他,NCBI数据上传二代fastq测序数据解读

9,高级生物信息分析课程:重测序数据自主分析二代测序转录组数据自主分析微生物扩增子分析课程实操

10.全部课程可点击:组学大讲堂视频课程


0 条评论

请先 登录 后评论
omicsgene
omicsgene

生物信息

698 篇文章

作家榜 »

  1. omicsgene 698 文章
  2. 安生水 347 文章
  3. Daitoue 167 文章
  4. 生物女学霸 120 文章
  5. xun 82 文章
  6. 红橙子 78 文章
  7. rzx 74 文章
  8. CORNERSTONE 72 文章