基因家族分析,既是一个可以快速掌握的生物信息分析技能,也是低成本SCI文章思路。
基因家族文章写作模式相似,换个物种或者基因家族就又是一篇文章,可借鉴性很强,且发文数量依然不减,是低成本短、平、快SCI文章的经典思路。
掌握以下10个分析技能,您也能写一篇基因家族的文章啦!
1、搜索基因家族成员蛋白保守结构域,鉴定基因家族成员;
2、预测基因家族成员的顺势作用元件;
3、构建系统进化发育树;
4、基因家族成员MOTIF分析及绘图;
5、基因结构图;
6、确定基因在染色体上的位置;
7、MCScanX共线性分析,绘制基因组内基因家族成员共线性circos图;
8、计算串联重复基因的KA/KS;
9、和其他物种进行共线性分析;
10、结合转录组数据绘制该基因家族的表达量热图。
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7月20日起,每次2课时,7月29日结束,课后有回放。
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