序列分析软件-DNAman使用介绍（二）
上一期给大家介绍了使用DNAman进行多重序列比对的方法，想了解的可以点击链接查看：多序列比对分析-Dnaman很好用！其实DNAman还有很多其他功能，今天我在和大家分享一下。
1. 绘制质粒图谱
绘制质粒图谱是DNAman比较成熟的功能之一，装载好质粒序列后（装载方法见：多序列比对分析-Dnaman很好用！）进行如下操作：点击Restriction-Draw Map，然后双击对话框右侧箭头所指即可打开参数设置对话框，如下如：
General是图参数常规设置，具体参数含义见下图：
Elements比较重要，是添加元件的选项，可以设置元件类型颜色及命名，元件设置成功后鼠标选中还可以移动位置。
Text可以添加文字及设置文字格式；Sites可以添加酶切位点；Drawing可以绘制着重框，成品图见下方：
2. 序列展示
DNAman可以多形式展示序列信息,可通过复选框选择所需内容形式：如下：
3. 蛋白质翻译
DNAman可以快速翻译蛋白质序列，操作也非常简单，参数设置及结果见下图：
4. 在线Blast比对
DNAman提供快速NCBI比对功能，并提供多种比对形式，如下图：
5. 开放阅读框（ORF）预测
DNAman提供开放阅读框预测，如下图，可展示氨基酸氨基酸数量、起止位置：
DNAman除了以上功能外，还有其他功能，如设计PCR引物、检索SiRNA等，但是个人感觉不是很好用，所以这里就不再细述了，感兴趣的可以自己尝试下！
1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程
2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读
3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，提升你的文章档次，学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析
4. 转录组数据怎么挖掘？多学点数据处理技能：学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘
6. 学生物的必学生信技能：linux系统入门
7. 学生物的必学生信技能：Perl语言入门到精通
8. 学生物的必学生信技能：perl语言高级编程
9. 更多学习内容：linux、perl、R语言画图，更多免费课程请扫描下方二维码：
- 发表于 2020-09-07 09:24
- 阅读 ( 16397 )
- 分类：软件工具
