GWAS抗性性状处理,耐盐,耐寒,耐旱等

GWAS抗性指数处理,耐盐,耐寒,耐旱等

方法1:计算抗性指数用于GWAS分析

GWAS分析一些抗性指标时候,我们一般会做对照与处理,分别调查处理和对照的多种性状数据,然后计算抗性指数:

 The response of the genotypes to salt stress was expressed using the stress susceptibility index (SSI) calculated according to Fischer and Maurer39 using the following formula: SSI = (1 − Ys/Yp)/D, where Ys = mean performance of a genotype under stress; Yp = mean performance of the same genotype without stress; D (stress intensity) = 1 − (mean Ys of all genotypes/mean Yp of all genotypes).


方法2:苗期处理,利用死亡率做为抗性指标


参考文献:

https://academic.oup.com/dnaresearch/article/22/2/133/332691#4590366

Fischer R.A. Maurer R. 1978, Drought resistance in spring wheat cultivars. I. Grain yield responses, Crop Pasture Sci., 29, 897–912.



GWAS关联分析课程推荐:https://bdtcd.xetslk.com/s/2KgXQq


  • 发表于 2020-12-17 18:14
  • 阅读 ( 2461 )
  • 分类:GWAS

0 条评论

请先 登录 后评论
omicsgene
omicsgene

生物信息

698 篇文章

作家榜 »

  1. omicsgene 698 文章
  2. 安生水 347 文章
  3. Daitoue 167 文章
  4. 生物女学霸 120 文章
  5. xun 82 文章
  6. 红橙子 78 文章
  7. rzx 74 文章
  8. CORNERSTONE 72 文章