最近,有老师反应转录组分析结果中,有两个GO分析文件中同一GO term的基因数量不一样,如下图黄色部分所示:
这里来解释一下,第一个表是做差异表达基因GO分类时用到的统计结果,每个GO term 的基因数量都包含其子节点的注释到的基因数目,而第二个表格是做差异基因GO富集分析用到的统计结果,这里每个GO term的基因数只包含自己注释到的基因数,所以会比第一个表里数量少很多。
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