blast+命令选择
blast+命令选择
blast+包含有五种BLAST，如下图所示：
每条命令作用如下：
blastp：使用blastp来将一个蛋白质查询序列与一个蛋白质数据库进行比较。
blastn：使用blastn来将一个DNA查询序列的两条链与一个DNA数据库进行比较。
blastx：使用blastx来将一个DNA序列用所有可能的阅读框翻译成6个蛋白质序列，然后将它们逐一与蛋白质数据库进行比较。
tblastn：使用tblastn来将一个DNA数据库中的每一条序列翻译成6种可能的蛋白质，然后将你要查询的蛋白质序列与翻译的蛋白质逐一进行比较。
tblastx：使用tblastx将查询DNA以及数据库中的DNA都翻译成6种可能的蛋白质，然后进行36次蛋白质－蛋白质数据库搜索。
需要根据自己需求选择合适的命令。
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- 发表于 2021-09-10 13:37
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- 分类：软件工具
