在线绘制基因染色体位置图
在线绘制基因染色体位置图
之前我们在 绘制基因染色体位置图 这篇文章里介绍了Mapchart软件绘制基因染色体位置图。今天再介绍一个可以绘制染色体位置图的在线网站——MapGene2Chrom。
网站地址：http://mg2c.iask.in/mg2c_v2.1/。
输入文件准备
绘制染色体位置图需要准备两个文件：基因位置文件和染色体长度文件。基因位置文件格式如下：
AT1G06180.1 1889408 1891158 Chr1
AT1G08810.1 2819065 2820395 Chr1
AT1G08810.2 2819068 2820020 Chr1
AT1G09540.1 3086159 3087912 Chr1 blue
AT1G09770.1 3161841 3165360 Chr1 red
第一列为基因ID；第二列为基因起始位置；第三列为基因终止位置；第四列为；基因所属染色体名称；第五列为设置基因的颜色。
染色体长度文件格式如下：
Chr1 30427671
Chr2 19698289
Chr3 23459830
Chr4 18585056
Chr5 26975502
第一列为染色体名称；第二列为染色体长度。
绘图
准备好输入文件后即可打开MapGene2Chrom网站绘制图片了。将基因位置信息和染色体长度信息分别输入对应的文本框中，点击 “DRAW” 绘图，生成图片如下。
网站左侧还可以设置一些参数，对图片进行修改：
如设置染色体名称的字体、大小和颜色，染色体的宽高以及颜色，基因名称的字体大小及显示方式等。大家可以试着设置一下，绘制自己需要的图片，小编这里就不细讲了。
绘制好图片后即可下载需要的图片格式。
好了，今天就到这里，大家操作一下试试吧，下期再见！
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- 发表于 2021-11-12 15:30
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- 分类：软件工具
