fastq序列做NR库比对

fastq序列做NR库比对


1.使用命令随机从fastq文件中提取序列：

python /share/work/huangls/piplines/01.script/random_fastq_to_fa.py -f  C5_R1.fastq.gz -o ~ -p its5 -n 100


2.将序列提交到NCBI中用blast做NR/NT库中进行比对：https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 

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  • 发表于 2021-12-07 15:53
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