docker作为一个虚拟化工具,可以让我们直接使用镜像里面的生信分析软件分析我们的数据,省去安装linux软件的麻烦,对于初学linux的学员非常有用。
我们的《Docker生物信息工具安装与使用》课程讲解了在windows系统中docker的安装与使用。这有助于学员使用自己的笔记本电脑或者台式机分析一些小型的数据。但是高通量测序的下机数据往往都很大,动辄几十上百G,这时,笔记本或台式机的内存、CPU以及存储就受到了限制,我们必须借助大型的linux服务器来分析我们的数据。
因此,我们组学大讲堂更新了《Docker生物信息工具安装与使用》课程:增加了一节“Docker在Linux系统安装与使用”,旨在指导学员在linux服务器中使用docker分析自己的数据。
Docke的安装
yum install docker-ce docker-ce-cli containerd.io docker-compose-plugin systemctl start docker #启动 docker 服务 systemctl enable docker #设置开机启动docker服务 docker version #显示 Docker 版本信息 docker info #显示docker安装信息
详细的安装方法见:https://docs.docker.com/engine/install/centos/
普通用户(非root用户)使用docker服务需要将用户添加到docker组中,添加方法见:https://www.omicsclass.com/article/1186
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为了方便学员的学习和使用,我们特更新了《Docker生物信息工具安装与使用》课程,其中最后一个课时是更新的内容。
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