hmmer之hmmbuild用法

hmmer之hmmbuild用法

hmmbuild: 用多重比对序列构建HMM模型;

使用hmmbuild构建HMM模型,输入为Stockholm格式或者FASTA格式的多重比对序列文件(如:tutorial/globins4.sto),命令如下:

hmmbuild test.hmm test.fas,其中test.fas为多序列比对结果(ClustalW方法比对),test.hmm则为产生的矩阵输出的HMM模型

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  • 发表于 2022-11-14 11:37
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  • 分类:软件工具

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生信阿姨
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