blastp 快速比对注释基因,输出注释信息

blastp -query unknown.pep.fa -db /share/work/database/blastdb/swissprot/uniprot_sprot.fasta -num_threads 10  -evalue 0.000001 -seg yes -soft_masking true -lcase_masking -max_hsps 1...

blastp -query unknown.pep.fa -db /share/work/database/blastdb/swissprot/uniprot_sprot.fasta -num_threads 10  -evalue 0.000001 -seg yes -soft_masking true -lcase_masking -max_hsps 1 -outfmt "6 qseqid sseqid qlen slen pident length  mismatch gapopen qstart qend sstart send evalue bitscore qcovs stitle"  -out uniprot.blast.out.tsv


diamond blastp --query  best_candidates.fasta --db /share/work/database/blastdb/swissprot/uniprot_sprot.fasta.dmnd --threads 10  --evalue 0.000001  --outfmt 6 qseqid sseqid qlen slen pident length  mismatch gapopen qstart qend sstart send evalue bitscore stitle  --out uniprot.blast.out.tsv

  • 发表于 2022-11-21 16:35
  • 阅读 ( 1259 )
  • 分类:转录组

你可能感兴趣的文章

相关问题

0 条评论

请先 登录 后评论
omicsgene
omicsgene

生物信息

698 篇文章

作家榜 »

  1. omicsgene 698 文章
  2. 安生水 347 文章
  3. Daitoue 167 文章
  4. 生物女学霸 120 文章
  5. xun 82 文章
  6. 红橙子 78 文章
  7. rzx 74 文章
  8. CORNERSTONE 72 文章