MNP标记设计中DP的计算方法 - 组学大讲堂问答社区

MNP标记设计中DP的计算方法

MNP标记设计中DP的算法

MNP标记设计中多态性窗口的筛选标准为DP指标： DP= t / c ( N ,2)，其中c ( N ,2) 是N 个品种中任意两种的品种组合对数， t是每对品种在窗口内至少有两个分散的 SNP 的数量。

如下所示：

假如有3个品种，1个窗口内有3个SNP。其中品种1与品种2有两个SNP的基因型不同，记为1；品种1与品种3也有两个SNP的基因型不同，记为1；品种2与品种3只有1个SNP的基因型不同，不计数。所以 t 的数量就是2。

发表于 2023-05-08 16:34
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分类：软件工具

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