构建一致性序列

构建一致性序列

构建一致性序列方法如下：

1.将vcf文件压缩

bgzip -c  raw.filtered.snp.vcf > raw.filtered.snp.vcf.gz

2.建立索引

tabix raw.filtered.snp.vcf.gz

3.构建一致性序列

bcftools consensus -f Ghirsutum_527_v2.0.fa raw.filtered.snp.vcf.gz > new.fa






  • 发表于 2023-05-19 11:33
  • 阅读 ( 5450 )
  • 分类：软件工具

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安生水
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