计算RNASeq 的Power值

计算RNASeq 的Power值

随着高通量测序技术的发展,RNA-Seq已经成为差异基因表达研究中的常规检测方法。RNA-Seq实验设计最重要内容之一就是选择最佳生物重复数以获得所需统计效能(sample size estimation,样本大小估计),或者估计在数据集中成功发现统计意义的可能性(power estimation,效能估计)。重复次数不足可能导致结论不可靠,而重复次数过多可能导致时间和资源浪费,因此需要研究者在研究成本和实验效能之间寻求权衡。

RnaSeqSampleSize基于多重检验中的FDR错误控制,并利用真实数据的平均read counts和离散分布来估计可靠的样本大小。


在线网址为:https://cqs-vumc.shinyapps.io/rnaseqsamplesizeweb/

用法如下:

attachments-2023-05-oAoZxEwm64746ac98e47a.png
read count 表达量数据格式如下:


attachments-2023-05-16PC8OCG64746bcd964f0.png

  • 发表于 2023-05-29 13:25
  • 阅读 ( 2035 )
  • 分类:软件工具

0 条评论

请先 登录 后评论
安生水
安生水

351 篇文章

作家榜 »

  1. omicsgene 702 文章
  2. 安生水 351 文章
  3. Daitoue 167 文章
  4. 生物女学霸 120 文章
  5. xun 82 文章
  6. rzx 78 文章
  7. 红橙子 78 文章
  8. CORNERSTONE 72 文章