随着高通量测序技术的发展,RNA-Seq已经成为差异基因表达研究中的常规检测方法。RNA-Seq实验设计最重要内容之一就是选择最佳生物重复数以获得所需统计效能(sample size estimation,样本大小估计),或者估计在数据集中成功发现统计意义的可能性(power estimation,效能估计)。重复次数不足可能导致结论不可靠,而重复次数过多可能导致时间和资源浪费,因此需要研究者在研究成本和实验效能之间寻求权衡。
RnaSeqSampleSize基于多重检验中的FDR错误控制,并利用真实数据的平均read counts和离散分布来估计可靠的样本大小。
在线网址为:https://cqs-vumc.shinyapps.io/rnaseqsamplesizeweb/
用法如下:
read count 表达量数据格式如下:
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