Proteus是一个用于MaxQuant输出下游分析的R包。记录下安装方法如下：
1.安装BioConductor 和limma
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install()
BiocManager::install("limma")
2.安装devtools，安装带有示例数据的附加包
install.packages("devtools")
devtools::install_github("bartongroup/proteusLabelFree")
devtools::install_github("bartongroup/proteusTMT")
devtools::install_github("bartongroup/proteusSILAC")
3.安装proteus
devtools::install_github("bartongroup/Proteus", build_opts= c("--no-resave-data", "--no-manual"), build_vignettes=TRUE)
Note: use build_vignettes = FALSE if you run into problems with vignettes installation.
