R 相关性系数计算 cor() 报错
转录组分析时，计算完FPKM后进行相关性计算并绘图，出现报错：
Error in seq.int(0, 1, length.out = n) :
'length.out' must be a non-negative number
该报错发生在选择颜色的函数colo...
转录组分析时，计算完FPKM后进行相关性计算并绘图，出现报错：
Error in seq.int(0, 1, length.out = n) :
'length.out' must be a non-negative number
该报错发生在选择颜色的函数colorRampPalette()上，发现是给的值出现问题，而值来自于相关性计算后的矩阵，发现矩阵结果为：
原因是用cor()计算相关性时，矩阵中存在NA，cor()计算前增加na.omit() 即可，修改为：
d<-round(cor(na.omit(fpkm)),4)
- 发表于 2023-09-06 10:01
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- 分类：R
