有参转录组数据分析镜像升级v2.0

有参转录组数据分析镜像升级v2.0

有参转录组数分析据镜像已经更新2.0:

1.主要是一些软件升级到最新如:fastp,samtools,htseq,一些R包等

2.增加一些软件,eggnog-mapper

3.非模式物种go kegg富集分析:更新绘图结果,富集分析限制物种类型等

4.差异基因分析脚本升级:支持一个分组文件做所有差异分析


使用方法:


docker pull omicsclass/rnaseq:v2.0
docker run -it -v ~/rnaseq:/work omicsclass/rnaseq:v2.0


如果需要用到最新的软件分析数据可以使用这个2.0版本的镜像,老用户重新下载示例数据压缩包

 

课程链接:https://bdtcd.xet.tech/s/29EigM




attachments-2023-10-XVhZcil765262908c36a9.png


  • 发表于 2023-10-09 11:54
  • 阅读 ( 1355 )
  • 分类:转录组

0 条评论

请先 登录 后评论
omicsgene
omicsgene

生物信息

698 篇文章

作家榜 »

  1. omicsgene 698 文章
  2. 安生水 347 文章
  3. Daitoue 167 文章
  4. 生物女学霸 120 文章
  5. xun 80 文章
  6. 红橙子 78 文章
  7. rzx 74 文章
  8. CORNERSTONE 72 文章