这个代码有两个主模块,DataFetcher and CountSummarizer
前者使用cr调用,用于从根据参考列提取数据,
比如有一个文件
想根据这里的某一列提取行,参考数据如下
使用代码,得到结果
后者使用ex调用,功能复杂一点,用法比较多不一一距离,常用于丰度估计
比如一个物种分类表然后我有名称对应的丰度表,比如
显示不全,看着不对应,实际上是几万行相互对应的,我现在想知道每个分类层级那些物种都有多少丰度,就用代码
生成了3个文件,
随便看一个
就是order级别各个物种在不同样本里的丰度占比
这个在功能注释里用的更多,有兴趣可以看一下,具体代码见文章
https://www.omicsclass.com/article/2329
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