使用NCBI——Batch Entrez批量下载蛋白序列
使用NCBI自带的工具实现蛋白序列的批量下载
NCBI自带的Batch Entrez工具可以根据基因/蛋白id在数据库中批量检索和下载基因/蛋白序列，首先进入网站：
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/batchentrez
准备一个包含全部基因/蛋白编号的文本文件(ID.txt),格式如下:
点击选择文件，选择ID.txt文本文件，database类型选择Protein（如果下载的是基因序列选择Nucleotide）：
点击Retrieve，进入如下页面：
点击Retrieve records for XX UID(s)，进入搜索结果页面，点击send to，选择输出为fasta格式文件，下载：
这样我们就获得了想要下载的全部蛋白序列：
- 发表于 2023-11-01 13:53
- 阅读 ( 9744 )
- 分类：软件工具
