从cytoscape官网获取安装包,下载链接:https://cytoscape.org/download.html
我下载的cytoscape版本为3.10:
下载后解压安装发现如下报错:
怀疑是java版本的问题,使用cytoscape提供的环境自查脚本“windows.bat”,脚本这里下载:
https://cytoscape.org/troubleshooting.html
运行脚本,检查安装环境
发现对应cytoscape3.10.1安装的java版本应该在17-22,于是下载java17,并配置环境变量,java17下载地址如下:
https://www.oracle.com/java/technologies/javase/jdk17-archive-downloads.html
下载和环境配置方法参考:https://www.omicsclass.com/article/298
再次安装成功。
安装过程中发现cytoscape的网页下载速度很慢,换成迅雷下载很快就下完了,推荐使用。
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