R中的错误处理函数

很多时候简单的try函数就能够增加脚本的鲁棒性,随着脚本逐渐复杂,一些较高级的错误处理函数就必不可少了,我们今天来介绍几个R中的 1. tryCatch() 函数 功能: tryCatch() 函数是一种更复杂...

很多时候简单的try函数就能够增加脚本的鲁棒性,随着脚本逐渐复杂,一些较高级的错误处理函数就必不可少了,我们今天来介绍几个R中的

1. tryCatch() 函数

功能: tryCatch() 函数是一种更复杂的错误处理机制。它不仅可以捕获错误,还可以定义针对不同类型错误的具体处理行为,基本是try的上位替代,还在try的框架内。
tryCatch({
  log(-1)  # 可能错误的代码
}, warning = function(w) {
  print("警告")
}, error = function(e) {
  print("错误")
}, finally = {
  print("这是最终的代码块,无论如何都会执行")
})

2. stopifnot()

功能: stopifnot() 函数用于断言检查,确保给定的条件为真。如果条件不满足,则函数会产生错误。这是一种快捷的方式来保证函数的输入或状态符合预期。

myFunction <- function(x) {
  stopifnot(is.numeric(x), x > 0)
  # 如果 x 不是数值类型或者不大于0,上面的代码会停止执行并抛出错误     ... has_na <- anyNA(marker_table(nested_results[[res_name]])$enrich_group) stopifnot(!has_na)
  # 其他计算
}
myFunction("a")  # 会抛出错误

2. withCallingHandlers() 和 withRestarts()

功能: 这两个函数用于更复杂的错误处理场景。withCallingHandlers() 允许定义错误处理程序,而 withRestarts() 允许定义恢复点,以便在错误发生时选择不同的恢复策略。

withCallingHandlers({
  withRestarts({
    sqrt(-1)  # 产生错误的代码
  }, myRestart = function() "选择了自定义的恢复策略")
}, warning = function(w) {
  print("发生了警告")
}, error = function(e) {
  invokeRestart("myRestart")
})
  • 发表于 2023-12-19 14:39
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  • 分类:R

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