基于微生物16s测序数据中的OTU丰度矩阵可以进行微生物互作网络构建,从而探索微生物之间的互作关系。而网络的构建方法多种多样,下面给大家推荐一个网站,Microbial association network construction tutorial (打开链接可以点这里),列举了多种常用互作关系分析的方法(如下图)。
点击对应的分析方法,就可以看到比较细致的分析步骤了,当然,也可下载到相关的文献资料。针对截面数据或者时间序列数据,以及数据处理的差异,可以选择不同的方法进行分析。
不过网页整体内容都是针对比较主要的参数进行了设置,没有细致的原理介绍,教程由英文进行说明,对于刚入门的新手而言学习还是有一定的难度的,可以给大家推荐网易云课堂相关课程,涉及了三种构建微生物互作网络的方法,内容讲解通俗易懂:
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