使用compare_means()t.test进行显著性检验时报错

compare_means()函数进行t.test时报错——“not enough 'x' observation”

compare_means()函数用于比较两个或多个独立样本之间的均值。

compare_means( f, data = mydata, paired =FALSE, method = "t.test") #函数的普遍用法

f : formula,x ~ group形式的公式,其中x是表示数据值的数值变量,group是表示相应组的具有一个或多个级别的因子。例如公式= TP53 ~ cancer_group

data : formula中的数据来源

paired:是否需要执行配对检验

method:默认是wilcox检验,可选T

在使用如上指令进行t检验时报错——“not enough 'x' observation”:

attachments-2024-01-bhG57FVC65960f3c51dc9.png

检查数据发现,两个分组数据(with_SV、without_SV)中的一个分组,with_SV中只有一个数据,而T检验要求每个分组中至少有两个观测值:

attachments-2024-01-aqJg1wJC65960fb9bb031.png

将不合格的数据从数据框中清除可以正常分析。

  • 发表于 2024-01-04 09:57
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  • 分类:R

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