eQTplot包绘图报错解决:“Caused by error in `db_collect()`”

解决dbplyr和BiocFileCache不兼容导致eQTplot包绘图时报错的问题

使用eQTplot包绘图时报错“Caused by error in `db_collect()`”:

attachments-2024-06-9mYsI1fM6680b2e09e851.png


大概查询了一下,应该是eQTplot需要调用dbplyr去查询ensemble数据库,dbplyr的功能描述——远程数据库查询:

attachments-2024-06-dNQrhvnG6680b803e3e32.png


最新版本的dbplyr和BiocFileCache存在不兼容的问题,对此官方也进行了说明:

attachments-2024-06-bKyUChVJ6680b8e2a3eaf.png

因此我们需要降低dbplyr包的版本:

#先删除以前安装的dbplyr
remove.packages("dbplyr")
#重新安装指定版本的dbplyr
devtools::install_version("dbplyr", version = "2.3.4")

问题解决:)

attachments-2024-06-thoBRAqW6680b9c3cdcf1.png


https://stackoverflow.com/questions/77370659/error-failed-to-collect-lazy-table-caused-by-error-in-db-collect-using

  • 发表于 2024-06-30 09:52
  • 阅读 ( 326 )
  • 分类:R

你可能感兴趣的文章

相关问题

0 条评论

请先 登录 后评论
每天学习一点点
每天学习一点点

44 篇文章

作家榜 »

  1. omicsgene 691 文章
  2. 安生水 340 文章
  3. Daitoue 167 文章
  4. 生物女学霸 120 文章
  5. 红橙子 78 文章
  6. xun 76 文章
  7. rzx 74 文章
  8. CORNERSTONE 72 文章