MITE属于II类非自主转座因子,可以使用MITE_Hunter进行检测,MITE_Hunter的运行一共有8步。
在运行第六步(-S 6)的时候出现报错:
发现第六步执行:
在MITE_Hunter_worker3.pl这个文件中check发现在比对之前都没有问题,但是比对的时候选择的软件不存在了,所以未能生成aln文件
修改MITE_Hunter_worker3.pl的147、150、263、266行的muscle所在位置即可。
注意版本和对应版本的用法。
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