pfamscan程序-translate和python的translate冲突问题

pfamscan程序-translate和python的translate冲突

报错信息:

运行pfam_scan.pl的时候报错:

attachments-2024-08-0f8ky2wi66cd90e0999ac.png

报错原因:

pfamscan程序-translate和python的translate冲突,报这个错是因为此时调用的是python里的translate

attachments-2024-08-jiRPsfLm66cd91505b9cf.png

解决办法:

把hmm里面的translate写到PATH里面并且居于比较优先调用的位置:

export PATH=/share/work/biosoft/hmmer/hmmer-2.3.2/squid:$PATH


  • 发表于 2024-08-27 16:44
  • 阅读 ( 363 )
  • 分类:软件工具

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Ti Amo
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