PASA报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, asmbl_link.cdna_acc
通常会从同源、转录组、从头三个方面进行基因结构注释，其中PASA是转录组注释的常用软件。
报错：
把三代转录组数据投入PASA是出现报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, as...
通常会从同源、转录组、从头三个方面进行基因结构注释，其中PASA是转录组注释的常用软件。
报错：
把三代转录组数据投入PASA是出现报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, asmbl_link.cdna_acc
报错原因：
1. 转录本fasta文件存在名字相同的序列
2. 转录本序列名字中存在"/"
解决方法：
如果是名字中存在"/"，采用sed修改即可
sed -i "s/\//-/g" fa文件
- 发表于 2024-09-30 13:50
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- 分类：软件工具
