安装R包出现链接库缺失的问题

 unable to load shared object '/home/wanghj/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2/00LOCK-igraph/00new/igraph/libs/igraph.so':  libglpk.so.36: cannot open shared object file: No such fi...
 unable to load shared object '/home/wanghj/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2/00LOCK-igraph/00new/igraph/libs/igraph.so':
  libglpk.so.36: cannot open shared object file: No such file or directory

如上面的报错,这个时候最简单的办法是通过locate查看是否存在链接库(linux里)

locate libglpk.so
/usr/local/lib/libglpk.so
/usr/local/lib/libglpk.so.36
/usr/local/lib/libglpk.so.36.1.2

存在库文件,所以有两种办法,第一是export到LD_LIBRARY_PATH里,

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lib:$LD_LIBRARY_PATH
# 然后再重新开一个R,然后安装包
R
install.packages("igraph")


或者在R里设置LD_LIBRARY_PATH


例如

Sys.setenv(LD_LIBRARY_PATH="/usr/local/lib")
install.packages("igraph")
  • 发表于 2024-10-24 10:35
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  • 分类:R

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