annovar的染色体识别问题
如果是非数字形式的染色体编号（尤其是其中有特殊字符），annovar的注释可能会有问题，需要改成数字格式
annovar对于染色体编号的识别是有固定的标准的，一般情况下，annovar识别非数字的染色体编号可能会有问题，比如下面这种：
发现使用annovar对如上染色体编号的vcf文件注释出来的基因是空的，对其中的特殊符号“-”进行替换，替换成“.”或者“_”均可，重新注释：
这样就能够注释到基因了，因此在进行变异位点的注释之前，要尽量把染色体改成数字的形式，如果是NCBI的数据，也可以查询到NC编号对应的数字：
- 发表于 2024-11-22 10:02
- 阅读 ( 156 )
- 分类：软件工具
