GATK是我们重测序流程中经常使用到的软件,他的下载比较简单,但是今天在配置的时候出现了一点小问题
wget https://github.com/broadinstitute/gatk/archive/refs/tags/4.6.2.0.tar.gz
tar zxvf gatk-4.6.2.0.tar.gz
cd gatk-4.6.2.0
./gradlew bundle
对gatk-4.6.2.0/gradle/wrapper下面的gradle-wrapper.properties这个文件进行更改,主要是更改这个文件的distributionUrl=一行,后面换成国内的镜像就可以了,我是用了阿里云的
distributionUrl=https\://mirrors.aliyun.com/gradle/distributions/v8.10.2/gradle-8.10.2-bin.zip
如果觉得我的文章对您有用,请随意打赏。你的支持将鼓励我继续创作!