做韦恩图？自己搞定！
韦恩图又称文氏图，是科研文章中最常见的图，可以用来表示多个数据集之间的关系。当然也可以进行集合运算。绘制韦恩图的工具有很多，在此，小编简单介绍几种在线绘制韦恩图的工具。
1. Venny 2.1
软件地址：http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html
Venny 2.1可以绘制4维及以下的韦恩图，用法如下图所示：
首先在左侧四个方框中输入各组数据，其上方可修改组合名称，软件会计算各组数据的重叠，并绘制圆圈大小相同的维恩图。在右侧的上方可以对图片进行简单修改，例如文字大小、线条粗细以及颜色等。点击每个区域的数字，在左侧下方可以显示该区域的基因列表。右键鼠标选择“图片另存为”可以保存图片，格式为PNG。
2. Draw Venn Diagram
软件地址：http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/
Draw Venn Diagram 能够绘制多维韦恩图，用法如下图所示：
左侧输入数据，这里既可以导入文件，也可以直接输入组合的列表，如果输入框不够，可以点击"Add"添加新的输入框。右侧可填写对应组合的名称。以输入列表为例，点击提交，短暂等待后可得到结果文件。如下：
首先是输入数据的统计情况，之后是得到的维恩图，有两种格式（PNG和SVG）可以下载，最后是各区域的基因列表，此文件可以导出。
3. BioVenn
软件地址：http://www.biovenn.nl/index.php
BioVenn只能绘制3维及以下的韦恩图，不过圆圈的大小可以随数据集大小而变化，并且对图片的编辑选项也更多，更能映射到Ensembl gene ID，用法如下图所示：
左侧上方的几个输入框是图片标题、副标题和3个数据集名称的输入地方，后面可以选择对应文字的字体、大小和颜色。还有是否显示数字可供选择。中间彩色的是输入各组数据的位置，同样有两种输入方法，最后可以修改圆圈的填充色。紧挨着下方红框选项可以将Affymetrix或EntrezGene IDs 映射为Ensembl Gene IDs。再下方的红框选择生成哪种格式的图片，在SVG格式下，图片中所有文字都是可以直接拖拽的（系统生成的图片文字位置可能会不太合适，我们可以自己调整一下）。生成图片后会在最下方显示统计的数据，点击数字会显示基因列表。
好了，今天小编就先给大家介绍这三款简单易用的韦恩图绘图工具，希望对您的科研能有所帮助！祝您工作生活顺心快乐！
R语言也可绘制韦恩图，具体请见 R语言绘图基础（ggplot2) 。
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- 发表于 2018-07-26 11:08
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- 分类：软件工具
