JASPAR是一个收录转录因子结合位点的网站,网站除了收集结合位点,还可以:
1. 预测蛋白是不是转录因子,查找转录因子的结合位点特征
2. 预测一段序列(启动子区)中有那些转录结合位点
其中预测启动子区的结合位点可以采用网站提供是“Scan” 实现。具体如下:
1. 首先搜索转录因子结合位点,比如搜索人类的所有转录因子结合位点
2. 选择要搜索的转录因子结合位点特征
3. 输入启动子区的序列,点击“Scan” 运行
结果如下:
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