在线绘制circos的数据格式说明

在线绘制circos的数据格式说明

在 教你在线绘制circos图-简单!介绍了circos图的在线绘制方法,这里再介绍一下输入文件的格式。

1.您上传的文件必须是纯文本数据。该文件可以是空格或制表符分隔的。行名不可重复。列名亦是如此,行列名可相同。每一行必须有相同数量的字段。

任何#开头的行都被视为注释,而不是解析。空白行也被忽略。



attachments-2018-08-QUPe3PX85b6d32f6bcce3.jpg

2.缺失的字段使用连字符“-” 代替。

attachments-2018-08-2dgCcyyT5b6d335d434a0.jpg

3.数据文件开头可包含一行,指明列段的顺序。要正确地解析该文件,您必须使用col order检查row。

attachments-2018-08-UaUw7oqR5b6d3411c9ce4.jpg

同样地,前导行可指定行顺序。行和列顺序也可同时使用前导列和行指定的。

要正确地解析这个文件,您必须检查行与col顺序和行顺序。

attachments-2018-08-nEsfCwMc5b6d34da6fe1e.jpg

4.通常情况下,颜色会被自动分配给段。您可以通过包含一个包含RGB颜色的行(和/或列)来分配颜色到段。

如果一个列和一行共享一个标签(例如A),那么两个颜色定义(在颜色行和列中)必须是相同的(这里,255,136,0是橙色)

要正确地解析这个文件,您必须检查带有颜色列的行,以及颜色行。


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5.每段的大小是根据给定标签的总单元格值自动计算的。您可以通过包含一个大小的列和/或行来指定区段大小。

要正确地解析这个文件,您必须检查带有col大小和行大小的行。

attachments-2018-08-uMoVEF2a5b6d372b7cc75.jpg



详细说明可在这里 http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/samples/ 查看。

  • 发表于 2018-08-10 14:51
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  • 分类:软件工具

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安生水
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