R内置函数 cor() 可以用来计算相关系数:cor(x, method = c("pearson", "kendall", "spearman")),可计算pearson、kendall、spearman三种相关系数。
cor函数计算的是列与列间的相关系数,得到的举证C(i,j)是第i列与第j列相关系数。
例如如下数据:
log2Ratio_miR log2Ratio_Gene
-1.43072567351625 1.37874741391777
-1.43072567351625 1.11756970634256
-1.43072567351625 1.67994238012443
-1.43072567351625 3.05079253633835
-1.43072567351625 1.50329494091278
-1.43072567351625 1.18612566219656
-1.43072567351625 1.89027598062113
-1.43072567351625 3.50870147552217
-1.43072567351625 1.06781330535694
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