R语言-相关性矩阵分析

R语言-相关性计算

R内置函数 cor() 可以用来计算相关系数:cor(x, method = c("pearson", "kendall", "spearman")),可计算pearson、kendall、spearman三种相关系数。

cor函数计算的是列与列间的相关系数,得到的举证C(i,j)是第i列与第j列相关系数。 

例如如下数据:

log2Ratio_miR   log2Ratio_Gene
-1.43072567351625       1.37874741391777
-1.43072567351625       1.11756970634256
-1.43072567351625       1.67994238012443
-1.43072567351625       3.05079253633835
-1.43072567351625       1.50329494091278
-1.43072567351625       1.18612566219656
-1.43072567351625       1.89027598062113
-1.43072567351625       3.50870147552217
-1.43072567351625       1.06781330535694
cor计算相关性结果:

attachments-2018-08-TQqUeSKe5b766343c44d7.jpg



  • 发表于 2018-08-17 13:56
  • 阅读 ( 5620 )
  • 分类:R

0 条评论

请先 登录 后评论
安生水
安生水

351 篇文章

作家榜 »

  1. omicsgene 702 文章
  2. 安生水 351 文章
  3. Daitoue 167 文章
  4. 生物女学霸 120 文章
  5. xun 82 文章
  6. rzx 78 文章
  7. 红橙子 78 文章
  8. CORNERSTONE 72 文章