在构建ceRNA网络中,需要预测miRNA 靶向lncRNA。 我们可以采用targetscan, miRanda, RNAhybrid等软件进行预测,也可以采用在线的预测网站,今天就介绍一下LncBase。
1. 网站支持两种预测模式:基于实验验证的预测和电子预测两种模式
2. 使用比较简单:输入miRNA 和lncRNA的编号即可,适合少量的miRNA和lncRNA 预测
3. 支持数据库下载:如果分析miRNA或lncRNA较多的话,可以将该数据下载到本地,在本地进行预测分析
如果您对TCGA数据挖掘感兴趣,请学习我的TCGA系列课程:
如果觉得我的文章对您有用,请随意打赏。你的支持将鼓励我继续创作!