mcsan结果文件说明

mcsan结果文件说明

使用mcscan进行共线性分析会得到很多文件,对我们最有用的是 *.anchors 和  *.anchors.simple。下面分别进行说明。

*.anchors.simple  是共线性结果文件 ,如图:

attachments-2018-10-Kzw7kLJf5bc0373d9a2df.jpg

每一行是一个共线性区块,各字段含义:

ref_start_gene参考基因组共线性区块起始基因

ref_end_gene参考基因组共线性区块终止基因

query_start_gene查询基因组共线性区块起始基因

query_end_gene查询基因组共线性区块终止基因

Score得分

orientation方向(相同为正,反转为负)


*.anchors 共线性区块内基因信息文件,如图:

attachments-2018-10-bMz2OHiQ5bc0375bf1294.jpg

### 之间为一个共线性区块,每行是区块内基因对应关系

  • 发表于 2018-10-12 13:56
  • 阅读 ( 3705 )
  • 分类:软件工具

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安生水
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