一个植物ceRNA数据库-pceRBase
一个植物ceRNA数据库-植物也可以做ceRNA了
ceRNA(Competing endogenous RNA)是一种RNA间竞争结合miRNA的调控机制，该调控机制参与了生命的生长，发育，环境相应等多个过程，并发挥了非常重要的作用。
今天给大家介绍一个植物的ceRNA数据库。
PceRBase数据库简介
pceRBase(http://bis.zju.edu.cn/pcernadb/index.jsp)数据库是浙江大学陈铭教授实验室建立的一个涵盖28种植物的ceRNA数据库。
该网站功能比较强大，支持数据浏览，查找，ceRNA预测，统计分析和数据下载。基本功能介绍如下：
浏览
支持基于物种的名称快速浏览相关的ceRNA网络
查询
支持基于物种基因名称的简单快速查询
支持基于blast序列比对的序列相似性查询
网络
支持筛选部分ceRNA相互作用关系，进行网络图查看
功能分析
支持筛选一些ceRNA网络中的基因进行功能富集分析。
预测
支持通过输入miRNA, 转录本的序列进行ceRNA网络的预测
ceRNA网络调控是一个很好的调控机制，目前研究多集中在医学，植物中研究比较少，很是新颖，值得在植物中进行大规模的研究！期待你的第一篇ceRNA文章！
- 发表于 2018-11-16 15:45
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